Ruột giữa còn thông tạm thời với túi noãn hoàng qua ống noãn hoàng, còn gọi là ống rốn – ruột.

Ruột giữa được cấp máu chủ yếu bởi động mạch mạc treo tràng trên.

Đoạn tá tràng nằm phía dưới chỗ đổ của ống mật phát sinh từ ruột giữa; đoạn phía trên thuộc ruột trước.

Động mạch mạc treo tràng trên tạo thành trục trung tâm cho quá trình xoay của quai ruột giữa.

Quai ruột giữa được chia thành ngành đầu và ngành đuôi, lấy ống noãn hoàng làm mốc.

Ngành đầu phát triển chủ yếu thành đoạn xa tá tràng, hỗng tràng và phần lớn hồi tràng.

Ngành đuôi tạo nên hồi tràng cuối, manh tràng, ruột thừa, đại tràng lên và phần gần đại tràng ngang.

Quai ruột giữa xoay tổng cộng khoảng 270° ngược chiều kim đồng hồ khi nhìn từ phía trước phôi.

Động mạch mạc treo tràng dưới cấp máu cho các dẫn xuất chính của ruột sau.

Mầm gan là một chồi nội bì phát sinh từ thành bụng đoạn cuối ruột trước, gần tá tràng.

Ruột giữa dài nhanh trong khi khoang bụng còn nhỏ và gan tương đối lớn, khiến các quai ruột tạm thời thoát vào dây rốn.

Khi thoát vị sinh lý, quai ruột giữa xoay 90° ngược chiều kim đồng hồ quanh động mạch mạc treo tràng trên.

Các quai hỗng tràng trở về trước và thường nằm về bên trái ổ bụng.

Mầm manh tràng trở về sau cùng, ban đầu nằm dưới gan rồi mới hạ xuống hố chậu phải.

Ruột thừa hình thành từ phần xa hẹp của mầm manh tràng.

Khoảng hai phần ba gần đại tràng ngang được hình thành từ ngành đuôi của quai ruột giữa.

Khoảng một phần ba xa đại tràng ngang thuộc phạm vi phát triển của ruột sau.

Ruột sau tạo phần xa đại tràng ngang, đại tràng xuống, đại tràng sigma và phần trên trực tràng.

Vách niệu – trực tràng chia ổ nhớp thành xoang niệu – sinh dục ở trước và ống hậu môn – trực tràng ở sau.

Phần trên ống hậu môn có nguồn gốc nội bì ruột sau; phần dưới có nguồn gốc ngoại bì hố hậu môn.

Đường lược đánh dấu vị trí tiếp giáp giữa phần trên có nguồn gốc nội bì và phần dưới có nguồn gốc ngoại bì.

Thoát vị rốn bẩm sinh liên quan đến việc các quai ruột không trở lại hoàn toàn ổ bụng và thường được phủ bởi một màng.

Khe hở thành bụng thường nằm cạnh rốn, các quai ruột lộ trực tiếp và không được màng che phủ.

Túi thừa Meckel là di tích tồn tại của đoạn gần ống noãn hoàng ở bờ đối diện mạc treo của hồi tràng.

Khi toàn bộ ống noãn hoàng còn tồn tại, lòng hồi tràng có thể thông trực tiếp ra rốn.

Đoạn giữa tồn tại tạo nang nằm giữa rốn và hồi tràng, thường nối với hai đầu bằng các dải xơ.

Mạc treo có chân bám hẹp do xoay bất thường làm tăng nguy cơ xoắn ruột quanh trục động mạch mạc treo tràng trên.

Không xoay ruột làm ruột non chủ yếu nằm bên phải, còn đại tràng chủ yếu nằm bên trái.

Thiếu tế bào hạch thần kinh ruột do tế bào mào thần kinh không di cư đầy đủ làm đoạn ruột mất nhu động và gây phình đại tràng phía trên.

Các dây tế bào gan phát triển vào trung mô vách ngang; mô này tham gia tạo mô đệm gan và một số cấu trúc liên quan.

Phần lớn, hay phần gần, của mầm gan tạo các dây tế bào gan và hệ thống đường mật trong gan.

Chồi túi mật, còn gọi là phần đuôi của mầm gan, tạo túi mật và ống túi mật.

Tụy phát triển từ hai mầm nội bì riêng biệt xuất phát từ tá tràng: mầm tụy lưng và mầm tụy bụng.

Mầm tụy bụng tạo phần dưới đầu tụy và mỏm móc; mầm tụy lưng tạo phần còn lại của tụy.

Tụy vòng hình thành khi mầm tụy bụng bị chia đôi hoặc di chuyển bất thường, tạo mô tụy bao quanh tá tràng và gây hẹp hoặc tắc tá tràng.